Responsables: Laetitia Fouillen et Sébastien Mongrand

Laetitia Fouillen est ingénieur de recherche (IRHC) au CNRS. Initialement formé comme chimiste à l’Université Paris-Sud et de Strasbourg (France), elle obtient sa thèse en chimie analytique en 2009 à l’Université de Strasbourg (LSMBO, Dr A. Van Dorsselaer). Ensuite, elle rejoint le Département de Physiologie à l’Université de Fribourg (Suisse) pour un post-doctorat en neuropeptidomique. En 2011, elle intègre le LBM et est devenue depuis responsable de la plateforme lipidomique. (Lien ORCID).

Sébastien Mongrand est DR1 au CNRS. Il a défendu thèse en 1998 au LBM portant sur la biosynthèse des lipides chloroplastiques. Après un post-doctorat de trois ans à l‘université de Rockefeller (New-York, Etats-Unis) travaillant sur la voie de signalisation de l‘ABA, il a été recruté au CNRS en 2002. Il est maintenant directeur du laboratoire et anime l'équipe « Microdomaines membranaire et signalisation »  Il est animateur scientifique de la plateforme lipidomique.

Membres de la plateforme: P. Van Delft (AI), Y. Boutté (DR)

Activités

Depuis 2005, le LBM a créé un pôle d’analyse des lipides faisant partie intégrante de la plateforme Bordeaux Métabolome et de l’infrastructure nationale en métabolomique et fluxomique MetaboHub.

Le pôle Lipidome fédère les outils et les savoir-faire pour l’analyse (identification, caractérisation, quantification) des lipides dans leur grande diversité. Il est dédié à l’étude de nombreux organismes, allant des plantes, aux animaux en passant par les levures.

La plateforme Métabolome sert de support aux recherches en biologie, écophysiologie, génomique fonctionnelle et génétique dans le cadre de collaborations régionales, nationales et internationales. Elle sert également à l’analyse de produits dérivés de plantes et de divers organismes. Elle est notamment utilisé pour l’établissement et l’interprétation de profils lipidomiques, l’identification et l’analyse structurale de lipides et ‘analyse fonctionnelle du métabolisme des lipides.

La plateforme permet d’obtenir l’identification, la caractérisation ou la quantification (absolue ou relative) de divers lipides :

– Quantification par densitomètrie des classes de lipides
– Identification et quantification d’acides gras (de longue chaines, hydroxylé…), de waxes, de composés de la cutine et de la subérine, des « long chain based » (LCB)
– Quantification relative des espèces moléculaires de phospholipides (PC, PE, PG, PS, PI and PIPx), lipides neutres (TAG, DAG, steryl ester…), des sphingolipides de plantes (Cer, GluCer et GIPC A&B)
– Régiolocalisation pour les espèces moléculaires de TAG
– Quantification des Alkyl HydroxyCinnamates (alkyl ferulate, alkyl coumarate et alkyl caffeate)
Les extractions et analyses peuvent être adaptées aux matériels biologiques utilisés.

Équipements Analytiques:

Pour nos analyses de lipides, nous utilisons différentes technologies: TLC, GC-FID, GC-MS et LC-MS. Les équipements analytiques peuvent être en mis à disposition après une formation spécifique.

Sélection d'articles:

– Mamode Cassim, A., Navon, Y., Gao, Y., Decossas, M., Fouillen, L., Grelard, A., Nagano, M., Lambert, O., Bahammou, D., Van Delft, P., Maneta-Peyret, L., Simon-Plas, F., Heux, L., Jean, B., Fragneto, G., Mortimer, J. C., Deleu, M., Lins, L., & Mongrand, S. (2021). Biophysical analysis of the plant-specific GIPC sphingolipids reveals multiple modes of membrane regulation. J Biol Chem, 100602.

– Ito, Y., Esnay, N., Platre, M. P., Wattelet-Boyer, V., Noack, L. C., Fougere, L., Menzel, W., Claverol, S., Fouillen, L., Moreau, P., Jaillais, Y., & Boutte, Y. (2021). Sphingolipids mediate polar sorting of PIN2 through phosphoinositide consumption at the trans-Golgi network. Nat Commun, 12(1), 4267.

– Platre, M. P., Bayle, V., Armengot, L., Bareille, J., Marques-Bueno, M. D. M., Creff, A., Maneta-Peyret, L., Fiche, J. B., Nollmann, M., Miege, C., Moreau, P., Martiniere, A., & Jaillais, Y. (2019). Developmental control of plant Rho GTPase nano-organization by the lipid phosphatidylserine. Science, 364(6435), 57-62.

– Delude, C., Fouillen, L., Bhar, P., Cardinal, M.-J., Pascal, S., Santos, P., Kosma, D. K., Joubès, J., Rowland, O., & Domergue, F. (2016). Primary alcohols are major components of suberized root tissues of Arabidopsis in the form of alkyl hydroxycinnamates. Plant Physiology, 171, 1934-1950.

– Kassas, N., Fouillen, L., Gasman, S., & Vitale, N. (2021). A Lipidomics Approach to Measure Phosphatidic Acid Species in Subcellular Membrane Fractions Obtained from Cultured Cells. Bio Protoc, 11(12), e4066.

– Brocard, L., Immel, F., Coulon, D., Esnay, N., Tuphile, K., Pascal, S., Claverol, S., Fouillen, L., Bessoule, J. J., & Brehelin, C. (2017). Proteomic analysis of lipid droplets from arabidopsis aging leaves brings new insight into their biogenesis and functions. Frontiers in Plant Science, 8, 894.

Anciens Membres

• 2012 Mélanie Onofre (BTS)
• 2013 Alice Choury (L3)
• 2013 Lynda Bensalem (M1)
• 2014 Lucie Combes-Soia (M1), Lionnelle Belanga (BTS)
• 2015 Julie Pinelli (AI MetaboHub), Florian Payen (M2)
• 2016 Sylvain Kenan (AI MetaboHub)
• 2017 Salimata Diarrassouba (AI MetaboHub)
• 2019 Alice Bacon (M2)
• 2020 Adriana Dinot (BTS)
• 2021 Marine Bayrand (L3), Erwan Goulevant (BTS), Amélie Perez (M2)
• 2022 Manon Genva (Post-doc), Delphine Bahammou (PhD)